Les congrégations participent au projet de l’ ICMA soit en tant que :

- Les Instituts fondateurs : ils sont les garants de l’ ICMA.
Ils sont au nombre de  trois (03) : la Société des Missions Africaines (SMA), l’Ordre des Frères Mineurs (OFM) et la Société des Missionnaires d'Afrique (les Pères blancs).

- Les Instituts associés : ils s’engagent à fournir du personnel et à envoyer des étudiants à l’ICMA. Ils sont deux (02) actuellement : La Congrégation de la Petite Œuvre de la Divine Providence et La Congrégation de Jésus et Marie appelé Eudistes.

- Les Instituts affiliés ou rattachés : ceux qui s’engagent à soutenir le projet et à envoyer des étudiants.
Ils sont actuellement au nombre de six (06). Il y a enfin d’autres congrégations qui s’intéressent à l’ICMA et envoient leurs étudiants sans prendre un engagement particulier.